Gravedad del Covid producido por las variantes Delta y Omicron: la experiencia de Ontario

Omicron tiene 37 mutaciones en la proteína espiga y ha reemplazado rápidamente a Delta como la variante dominante a nivel mundial, debido al aumento de la evasión inmunitaria. Es menos claro cómo se compara la gravedad de Omicron con la de Delta. Los primeros datos de Sudáfrica sugieren que Omicron puede ser menos grave que los linajes anteriores; sin embargo, la baja edad promedio de las personas infectadas, el alcance de la infección previa y las bajas tasas de vacunación afectan la generalización a otros países. En Ontario, Canadá, examinamos las hospitalizaciones y muertes asociadas con Omicron en comparación con pacientes infectados con Delta.

Métodos: realizamos un estudio de cohorte emparejado retrospectivo de toda la población de pacientes infectados con las variantes Omicron y Delta, utilizando conjuntos de datos de todo Ontario (gestión de contactos y casos de salud pública, que contiene todas las infecciones por SARS-CoV-2 diagnosticadas en Ontario, vinculadas a la Base de datos COVaxON, que contiene todos los registros de vacunación COVID-19). Se incluyeron los casos si el inicio se produjo entre el 22 de noviembre de 2021 (primer caso del sublinaje Omicron BA.1 en Ontario) y el 24 de diciembre de 2021. El período de estudio fue anterior a la aparición en enero de 2022 del sublinaje Omicron BA.2 en Ontario. La fecha de inicio del caso se definió por el inicio de los síntomas o, para los casos asintomáticos, la recolección de muestras. Se excluyeron los casos si faltaba la fecha de inicio, la edad o el sexo o si fueron adquiridos en el hospital.

Se envió una porción representativa (que descendió del 50 % al 10 % el 20 de diciembre de 2021) de muestras de casos con un umbral de ciclo de 30 o menos para la secuenciación del genoma completo (WGS). Entre el 6 y el 24 de diciembre de 2021, se realizaron pruebas de falla en el objetivo del gen S (SGTF) para todos los casos en Ontario. Los casos de Omicron se definieron como casos identificados por WGS, con SGTF y umbral de ciclo de 30 o menos antes del 13 de diciembre (fecha de prevalencia de 50 % de Omicron), o todos con SGTF después del 13 de diciembre. Los casos delta se definieron como casos detectados por WGS, casos con amplificación del gen S, o todos los casos no identificados como Omicron antes del 3 de diciembre (fecha de 5% de prevalencia de Omicron). desde la dosis de vacuna más reciente, región y fecha de inicio (±3 días).

Se usaron modelos de riesgos proporcionales de Cox que representan el agrupamiento dentro de conjuntos emparejados para determinar los cocientes de riesgos instantáneos (HR) para la hospitalización, las admisiones en la unidad de cuidados intensivos y las muertes para Omicron en comparación con los casos de Delta, y los IC del 95 %, en R (versión 4.1.0). La significación estadística se definió como un IC del 95% que excluyó 1. Se realizaron análisis estratificados para evaluar las diferencias en el riesgo por sexo, grupo de edad y estado de vacunación. En un análisis de sensibilidad, se excluyeron los posibles casos incidentales (primera toma de muestra positiva el día de la hospitalización o el día anterior). La Junta de Revisión de Ética de Salud Pública de Ontario determinó que no se requería la aprobación del comité de ética o el consentimiento informado porque se utilizaron datos de población no identificados.

Resultados: identificamos 37296 casos de Omicron que cumplían con los criterios de elegibilidad, de los cuales 9087 (24,4 %) se emparejaron 1:1 con casos de Delta (Tabla 1). La mediana del tiempo de seguimiento fue de 24 días (RIC, 21,0-28,0). Hubo 53 hospitalizaciones (0,6 %) y 3 muertes (0,03 %) entre los casos emparejados de Omicron en comparación con 129 hospitalizaciones (1,4 %) y 26 muertes (0,3 %) entre los casos emparejados de Delta. El HR para hospitalización o muerte entre los casos de Omicron en comparación con los casos de Delta fue de 0,41 (IC 95 %, 0,30-0,55; 0,33 [IC 95 %, 0,19-0,56] en el análisis de sensibilidad), mientras que el HR para ingreso en la unidad de cuidados intensivos o muerte fue 0,19 (IC 95 %, 0,09-0,39), y el HR para muerte fue 0,12 (IC 95 %, 0,04-0,37). Las estimaciones estratificadas de la gravedad de Omicron por edad, sexo y estado de vacunación indicaron una reducción de la gravedad de Omicron (Tabla 2).

Discusión: en este estudio emparejado de más de 9000 casos de Omicron en Ontario, el riesgo de hospitalización o muerte fue menor para los casos de Omicron en comparación con los casos de Delta. Los resultados se alinean con los hallazgos de Sudáfrica, Escocia e Inglaterra, todos los cuales han demostrado disminuciones sustanciales en el riesgo asociado con Omicron.4-6

Este estudio tiene algunas limitaciones, en particular, la corta duración del seguimiento, la posible clasificación errónea debido a hallazgos incidentales de la evaluación de la admisión al hospital y el seguimiento incompleto de salud pública a medida que aumenta la incidencia. Si bien la gravedad puede reducirse entre los casos de Omicron, es probable que el número absoluto de hospitalizaciones y los efectos en los sistemas de atención médica sean significativos debido a la elevada incidencia de Omicron.

El artículo original:

Ulloa AC, Buchan SA, Daneman N, Brown KA. Estimates of SARS-CoV-2 Omicron Variant Severity in Ontario, Canada. JAMA. Published online February 17, 2022. doi:10.1001/jama.2022.2274

Disponible en: https://bit.ly/3v1RKpq