Susceptibilidad genética para formas graves de COVID-19

En un estudio de genoma completo se identificaron diversos genes que se asocian a Covid-19 con insuficiencia respiratoria y se confirmó una posible participación del sistema de grupo sanguíneo ABO. New England Journal of Medicine, 17 de junio de 2020.

Resumen

Antecedentes: existe una variación considerable en el comportamiento de la enfermedad entre los pacientes infectados con el coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2), el virus que causa la enfermedad por coronavirus 2019 (Covid-19). El análisis de asociación del genoma completo puede permitir la identificación de posibles factores genéticos involucrados en el desarrollo de Covid-19.

Métodos: realizamos un estudio de asociación del genoma completo que involucró a 1980 pacientes con Covid-19 y enfermedad grave (definida como insuficiencia respiratoria) en siete hospitales en los epicentros italianos y españoles de la pandemia de SARS-CoV-2 en Europa. Después del control de calidad y la exclusión de los valores atípicos de la población, se incluyeron en el análisis final 835 pacientes y 1255 participantes de control de Italia y 775 pacientes y 950 participantes de control de España. En total, analizamos 8.582.968 polimorfismos de un solo nucleótido y realizamos un metanálisis de los dos paneles de casos y controles.

Resultados: detectamos asociaciones de replicación cruzada con rs11385942 en el locus 3p21.31 y con rs657152 en el locus 9q34.2, que fueron significativas a nivel del genoma (P <5 × 10−8) en el metanálisis de los dos paneles de casos y controles. (odds ratio, 1.77; 95% intervalo de confianza [IC], 1.48 a 2.11; P = 1.15 × 10−10; y odds ratio, 1.32; IC 95%, 1.20 a 1.47; P = 4.95 × 10−8, respectivamente) . En el locus 3p21.31, la señal de asociación abarcó los genes SLC6A20, LZTFL1, CCR9, FYCO1, CXCR6 y XCR1. La señal de asociación en el locus 9q34.2 coincidió con el locus del grupo sanguíneo ABO; en esta cohorte, un análisis específico del grupo sanguíneo mostró un mayor riesgo en el grupo sanguíneo A que en otros grupos sanguíneos (odds ratio, 1.45; IC 95%, 1.20 a 1.75; P = 1.48 × 10−4) y un efecto protector en el grupo sanguíneo O en comparación con otros grupos sanguíneos (odds ratio, 0.65; IC 95%, 0.53 a 0.79; P = 1.06 × 10−5).

Conclusiones: identificamos un grupo de genes 3p21.31 como un locus de susceptibilidad genética en pacientes con Covid-19 con insuficiencia respiratoria y confirmamos una posible participación del sistema de grupo sanguíneo ABO. (Financiado por Stein Erik Hagen y otros).

El artículo original:

Ellinghaus D, Degenhardt F, Bujanda L, et al, for The Severe Covid-19 GWAS Group. Genomewide Association Study of Severe Covid-19 with Respiratory Failure. N Engl J Med June 17, 2020. DOI: 10.1056/NEJMoa2020283

Disponible en: https://bit.ly/2BesX7H

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