Convalecencia de COVID 19: la PCR puede seguir positiva pero con virus no viable

La duración de la transmisibilidad de la enfermedad por coronavirus 2019 (Covid-19) y el nivel de contagio asociado han sido inciertos. Cultivamos el coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) en muestras respiratorias seriadas obtenidas de pacientes hospitalizados con Covid-19 para evaluar la duración de la diseminación del virus viable.

Los datos que se informan aquí representan a todos los pacientes con Covid-19, según lo confirmado por una prueba positiva de reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa en tiempo real (RT-PCR), que fueron hospitalizados en el Hospital Universitario Chung-Ang en Seúl, Corea del Sur, entre febrero y junio de 2020. Se utilizó el ensayo Allplex 2019-nCoV (Seegene) para muestras nasofaríngeas y orofaríngeas para las pruebas de RT-PCR en tiempo real. Los pacientes se aislaron hasta que se documentaron dos resultados consecutivos negativos o no concluyentes en RT-PCR en tiempo real, con un intervalo de al menos 24 horas. Intentamos obtener muestras en intervalos de aproximadamente 2 días, pero esto no siempre fue posible. El ARN viral se cuantificó con el uso del valor umbral de ciclo para el gen N del SARS-CoV-2. Se realizaron cultivos virales mediante un ensayo de placa hasta que al menos dos cultivos consecutivos no mostraron crecimiento.

Comparamos el tiempo desde el inicio de la enfermedad hasta el aclaramiento viral en cultivo con el tiempo hasta el aclaramiento en las pruebas de RT-PCR en tiempo real. Métodos detallados y sensibilidades del cultivo y ensayo de RT-PCR en tiempo real y la definición y estimación de el tiempo hasta la eliminación viral se describe en el Apéndice complementario.

Se estudiaron 21 pacientes con Covid-19. La mediana de edad fue de 62 años y el 76% de los pacientes eran hombres. El 71% tenía neumonía y el 38% estaba recibiendo oxigenoterapia complementaria. La puntuación mediana de la escala SOFA fue de 0 (las puntuaciones van de 0 a 24, y las puntuaciones más altas indican una disfunción orgánica más grave y un mayor riesgo de muerte), y la puntuación mediana de la escala APACHE II fue 5 (las puntuaciones van de 0 a 71, y las puntuaciones más altas indican una enfermedad más grave y un mayor riesgo de muerte); estas puntuaciones indicaron una enfermedad leve a moderada. Se analizaron un total de 165 muestras mediante RT-PCR en tiempo real a intervalos de 1 a 5 días (mediana, 2). De estas 165 muestras, 89 fueron cultivadas para SARS-CoV-2.

Se cultivó SARS-CoV-2 en 29 de las 89 muestras (33%). El tiempo medio desde el inicio de los síntomas hasta la eliminación viral en cultivo fue de 7 días (intervalo de confianza [IC] del 95%, 5 a 10), y el tiempo medio desde el inicio de los síntomas hasta el aclaramiento viral en RT-PCR en tiempo real fue de 34 días (límite inferior del IC95%, 24 días). El último cultivo viral positivo fue 12 días después del inicio de los síntomas (en el Paciente 6). Se identificó virus viable hasta 3 días después de la resolución de la fiebre (en el Paciente 14). El cultivo viral fue positivo solo en muestras con un valor de umbral de ciclo de 28,4 o menos. La incidencia de cultivo positivo disminuyó con un tiempo creciente desde el inicio de los síntomas y con un valor umbral de ciclo creciente.

Nuestros hallazgos pueden ser útiles para orientar los períodos de aislamiento de los pacientes con Covid-19 y estimar el riesgo de transmisión secundaria entre contactos cercanos en el rastreo de contratos. Dado el tamaño pequeño de la muestra, el momento inconsistente del muestreo y la enfermedad relativamente leve de los pacientes inscritos, nuestros resultados deben verificarse en grupos de pacientes más grandes y diversos.

El estudio original:

Kim M-C, Cui C, Shin K-R, et al. Duration of Culturable SARS-CoV-2 in Hospitalized Patients with Covid-19. N Engl J Med January 27, 2021. DOI: 10.1056/NEJMc2027040

Disponible en: https://bit.ly/3cw9WhQ