Informe acerca de las nuevas variantes de SARS-CoV-2 reportadas en Gran Bretaña y Sudáfrica
Se reporta un linaje de crecimiento rápido en el Reino Unido asociado a un número inusual de cambios genéticos, incluyendo el receptor RDB y asociado al sitio de clivaje de la furina.-Hay evidencia limitada respecto a la severidad de la nueva variante, ya que la mayoría de los casos reportados ocurrieron en individuos menores de 60 años, en los cuales sintomatología esperada es menos severa.-Debido a la evidencia experimental y posibles consecuencias fenotípicas de estos cambios, la falta de evidencia de su efecto combinado y la alta tasa de crecimiento de este linaje en Reino Unido, se requiere la caracterización en detalle del mismo, especialmente en su efecto sobre la neutralización por anticuerpos, por su potencial impacto en individuos vacunados y en aquellos que sufrieron ya infecciones por este virus.-Este linaje no comparte origen común con el reportado en Sudáfrica y ninguno de ellos con los aislamientos secuenciados hasta el momento en nuestro país. Sin embargo, es necesaria una vigilancia genómica continua por la diseminación global de la misma y posible introducción en nuestro país. ANLIS.Carlos G. Malbrán, 21 de diciembre de 2020
Introducción
En las últimas semanas, el Reino Unido ha enfrentado un rápido aumento de casos de COVID-19. Este incremento fue pronunciado en el sudeste de Inglaterra, con un aumento en la tasa de notificación de casos en 14 días de 100 casos cada 100.000 habitantes en la semana 41/2020 a más de 400 cada 100.000 en la semana 50/2020.
Esta situación derivó en una investigación epidemiológica y virológica intensificada. Los análisis realizados con los datos de secuencia del genoma viral identificaron que una gran proporción (>50%) de casos pertenecían a un nuevo cluster filogenético caracterizado desde el COG-UK (linaje B.1.1.7).
Este cluster tiene una cantidad inusual de cambios genéticos, especialmente en la proteína “S” o espícula. Tres de estas variaciones genéticas tienen efectos biológicos potenciales descriptos previamente:
La mutación N501Y que se ubica en la zona que codifica para uno de los seis residuos de contacto claves para la unión con el receptor RDB y ha sido asociada a un aumento de la afinidad con la ACE2 en humanos y en cerdos.
La deleción 69-70 que ha sido asociada a la evasión de la respuesta immune, que también se vió con otros cambios genéticos en la RDB.
La mutation P681H que se encuentra adyacente al sitio de clivaje de la furina, que es conocido por su importancia biológica.
El crecimiento inusualmente rápido de este linaje indica la necesidad de un aumento y mejora de la vigilancia genómica global y posteriores estudios de laboratorio para investigar los efectos en su antigenicidad e infectividad.