Vigilancia activa de variantes de SARS-CoV-2 en la CABA, provincias de Buenos Aires, Chaco, Neuquén, Santa Fe y Misiones, Reporte N°28.

Proyecto argentino interinstitucional de genómica de SARS-COV-2. Ministerio de Salud de la Nación,  Actualización al 28/10/2021.

Con el objetivo de estudiar las variantes circulantes del virus SARS-CoV-2 en el período comprendido entre el 20/07/21 y el 20/10/21, se analizaron un total de 568 muestras. De las cuales, 188 correspondieron a casos de la CABA, Gran Buenos Aires y alrededores y Gran La Plata, 25 de provincia de Buenos Aires (no AMBA), 18 de provincia de Chaco, 11 de la provincia de Misiones, 93 de Neuquén, y 190 de Santa Fe. Todas estas muestras estudiadas corresponden a individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros. Además, de las 568 muestras, 43 correspondieron a casos especiales (nexo con viajero y confirmación de casos detectados por la técnica de PCR en tiempo real específica para variantes). En 73 casos se realizó la secuenciación completa del genoma del SARS-CoV-2.

En total, se identificó la variante Alpha en 6 casos. La variante Gamma en un total de 286 casos, de los cuales 280 corresponden a casos de circulación comunitaria. La variante Lambda en 90 casos, de éstos, 85 corresponden a circulación comunitaria. Por último, la variante Delta se detectó en un total de 185 casos, de los cuales 153 corresponden a casos de circulación comunitaria seleccionados al azar.

A la fecha, sobre un total de 4992 muestras analizadas a través de la vigilancia activa por secuenciación de Spike o de genoma completo, las variantes más frecuentemente detectadas en nuestro país fueron: Gamma en 2163 casos, seguida de Lambda en 1070 casos, Alpha en 310 casos, Delta en 240 casos y Mu en tres casos.

En este reporte, se encontró que la frecuencia de detección de la variante Delta alcanzó el 83,3% (en el GBA), el 84,6% (en la CABA), 21,4% en la provincia de Santa Fe y 41,0% en la provincia de Neuquén en las últimas semanas epidemiológicas analizadas (segunda quincena de octubre). Estos resultados están en consonancia con la situación epidemiológica regional, hasta el momento caracterizada por un incremento de la frecuencia de detección de la variante Delta en simultáneo con el reporte de un número de casos estable o a la suba, tanto en Argentina como en otros países de la región.

El informe completo en https://bit.ly/3BtnOlF

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